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Research topics

  • Missing data in multivariate exploratory data analysis methods 
    • Missing values in principal component analysis, multiple imputation with and in PCA
    • Missing values in multiple correspondence analysis, in multiple factor analysis
  • Multiple multivariate dataset:
    • Multiple factor analysis: MFA is a method proposed by B. Escofier and J. Pagès (1984) and it deals with data tables in which a set of individuals is described by several sets of variables. More information concerning MFA (application in sensory analysis).
    • RV coefficient: the RV coefficient (Escoufier, 1973) is a correlation coefficient between two data tables

Books

  • P-A. Cornillon, A. Guyader, F. Husson, N. Jégou, J. Josse, M. Kloareg, E. Matzner-Løber, L. Rouvière. (2008, 2010) Statistique avec R. Presses Universitaires de Rennes 15 Euros.
  • P-A. Cornillon, A. Guyader, F. Husson, N. Jégou, J. Josse, M. Kloareg, E. Matzner-Løber, L. Rouvière. R for statistics.To be published in Chapman & Hall in june 2012.

Papers

    Published papers

  1. Josse, J. & Husson, F. (2011). Selecting the number of components in PCA using cross-validation approximations. To be published in Computational Statististics and Data Analysis.
  2. Josse, J., Chavent, M., Liquet, B. & Husson, F. (2011). Handling missing values with Regularized Iterative Multiple Correspondence Analysis. Journal of classification. To appear.
  3. Josse, J., Husson, H. & Pagès, J. (2011). Multiple imputation in PCA.  Advances in data analysis and classification. 5 (3) pp. 231-246.
  4. Josse, J., Husson, H. & Pagès, J. (2009). Gestion des données manquantes en Analyse en Composantes Principales. Journal de la SFdS. 150 (2), pp. 28-51.
  5. Josse, J., Pagès, J. & Husson, F. (2008). Testing the significance of the RV coefficient. Computational Statististics and Data Analysis. 53 , pp. 82-91.
  6. Lê S., Josse, J., Husson, F. (2008). FactoMineR: an R package for multivariate analysis. Journal of Statistical Software. 25 (1), pp. 1-18.

    7. Submitted papers

Conferences

    Talks

  1. Josse, J., Husson, F., Chavent, M. & Liquet, B. (2011). Multiple correspondence analysis with missing values. DAGM, GfKI conference, Frankfurt, Germany, 1-4 September. Invited session.
  2. Josse, J., Husson, F. (2011). missMDA : a package to handle missing values in and with multivariate exploratory data analysis methods. useR ! 2011 (The R user Conference), Warwick, England, August 15-20th. (abstract, slides).
  3. Josse, J., Husson, F., Chavent, M. & Liquet, B. (2011). Dealing with missing values in multiple correspondence analysis. International Classification Conference, St Andrew, Scotland, 11-15 July. (slides).
  4. Josse, J., Husson, F., Chavent, M. & Liquet, B. (2011). Handling Missing Values with Regularized Iterative Multiple Correspondence Analysis. Correspondence Analysis and Related MEthods, France, Rennes, 8-11 February. (slides).
  5. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2010). Variabilité des dimensions en ACP. Journée de la SFdS. Marseille, France, 24-30 mai. (long abstract).
  6. Husson, F., Josse, J. & Pagès, J. (2010). Complémentarité des méthodes d'analyse factorielle et de classifications. Journée de la SFdS. Marseille, France, 24-30 mai.
  7. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2009). Apport de l'ACP probabiliste pour la gestion des données manquantes en ACP. Journée de la SFdS. Bordeaux, France, 25-29 mai. (long abstract, slides).
  8. Josse, J., Husson, H. & Pagès, J. (2008). Test de signification du coefficient RV, application à des données de napping. 10èmes journées Européennes Agro-industrie et méthodes statistiques (AGROSTAT). Louvain-la-Neuve, Belgique, January, 23-25th. (slides).
  9. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2008). Missing Values in Multiple Multivariate Analysis. congrès joint SFdS-SSC. Ottawa, Canada, 24-29 mai. (slides).
  10. Husson, F., Josse, J. & Lê, S. (2008). FactoMineR, an R package for exploratory data analysis for teaching and research. congrès joint SFdS-SSC. Ottawa, Canada, 24-29 mai. (slides).
  11. Lê, S., Josse, J., Husson, F. (2007). FactoMineR, une librairie de fonctions R en analyse des données pour l'enseignement et la recherche. Journées de classification. Paris, France, 5-7 septembre. (abstract, slides).
  12. Josse, J., Lê, S. & Husson, F. Multivariate Analysis with the FactoMineR package. useR! 2007, Ames, Iowa, USA, August, 8–10th. (abstract, slides).
  13. Josse, J. Pagès, J. & Husson, F. (2007). Testing the significance of the RV coefficient. Congrès IASC. Aveiro, Portugal, August 30 - September 1st. (long abstract).
  14. Josse, J. & Matzner-Løber, E. (2007). Prévisions des pics d'ozone à Lorient. Journée de la SFdS. Angers, France, 11-15 juin. (long abstract - slides).
  15. E. Morand, Josse, J., Husson, H. & Pagès, J. (2007). Missing values in multiple multivariate dataset. ASMDA. Chania, Crete, Greece, May 29 - June 1. (slides).
  16. C. Coll, Josse, J., Benoît, D., Lebourges-Dhaussy, A., Josse, E., de Morais, L.T, Simier, M. and Lae, R. (2005). How to recognize the fish in the trees ? Methodological reflections for the fish population assesment in an artificial reservoir. ICES Working Group on Fischeries Acoustic Science and Technology (WGFAST). Rome, Italy, April, 19-22th. (abstract).
  17. Furon, T., Josse J. & Le Squin, S. (2004). Some theoretical aspects of watermarking detection. Security, Steganography and Watermarking of Multimedia Contents VII. San Jose, CA, USA, June. (long abstract).

    18. Tutorials

  18. Josse, J., & Husson, F. (2011). Panorama sur les méthodes d'analyse exploratoire des données (3h). Journées de l'Ecole Doctorale Pierre Louis de Santé Publique : Epidémiologie et Sciences de l'Information Biomédicale. St Malo, 20 octobre.
  19. Josse, J. (2011). Analyse Factorielle Multiple. Mise en oeuvre des méthodes multi-tableaux via le logiciel R (3h). Atelier de la SFdS. Paris, 1er avril.
  20. Husson, F. & Josse, J. (2010). Multivariate Data Analysis with a special focus on clustering and multiway methods (3h). useR!2010. Gaithersburg, Maryland, USA, July, 21-23 th.
  21. Husson, F., Josse, J. & Lê, S. (2008). Exploratory Data Analysis (3h). useR!2008. Dortmund, Allemagne, August, 11-14 th.

    22. Seminars

  22. Josse, J., Husson, F. (2011). Prise en compte des données manquantes en ACP. Séminaire devant des enseignants-chercheurs d'Agrocampus Ouest et de l'INRA. Rennes, 3 octobre. (slides)
  23. Josse, J., Husson, F. (2011). Missing values in exploratory data analysis. Séminaire de statistique de l'équipe psychometrie, Université de Leiden, Pays-Bas, 20 juin. (slides)
  24. Josse, J., Husson, F. (2011). Prise en compte des données manquantes en ACP; de l'imputation simple à l'imputation multiple. Séminaire de l'équipe de l'IUT de Caen Département STID. Caen. 22 mars.
  25. Josse, J., Husson, F. (2011). Prise en compte des données manquantes en ACP; de l'imputation simple à l'imputation multiple. Séminaire de l'équipe mathématiques et informatique appliqué (MIA), INRA, Jouy-en-Josas. 7 mars.
  26. Josse, J., Husson, F. (2011). Présentation de FactoMineR. Séminaire statistique et informatique pour les sciences humaines et sociales à l'Université Paris 1. Paris, 25 février.
  27. Husson, F. & Josse, J. (2010). Données manquantes en ACP, de l'imputation simple à l'imputation multiple. Seminaire à l'institut de mathématiques de Bordeaux (IMB), Bordeaux, 11 Mars.
  28. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2008). Données manquantes en Analyse Factorielle Multiple. Séminaire au groupe de travail en biostatistique à l'Institut Elie Cartan. Nancy, 13 juin. (slides).
  29. Husson, F., Josse, J. & Lê, S. (2008).  FactoMineR, une librairie de fonctions R en analyse des données pour l'enseignement et la recherche. Séminaire de l'INED. Paris, 5 juin.
  30. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2008). Données manquantes en Analyse Factorielle Multiple. Séminaire statistique à l'institut de recherche mathématique avancée (IRMA). Strasbourg, 7 octobre. (slides).
  31. Husson, F., Josse, J. & Lê, S. (2008). L'Analyse Factorielle Multiple avec FactoMineR. Séminaire de l'INED. Paris, 5 juin 2008.
  32. Josse, J., Husson, F. & Pagès, J. (2007). Missing values in multiple multivariate dataset. Présentation devant le GRoupe de travail en Analyse de Données, GRAD. Rennes, 23 mai. (slides).

Thesis

  • Ph. D defense: 22/10/10  Prise en compte des données manquantes en analyse exploratoire des données (slides in french)
    Jury : Gérard Govaert, Université de Compiègne (Rapporteur)
    Henk A.L. Kiers, University of Groningen, The Netherlands (Rapporteur)
    Michael Greenacre, University of Barcelona, Spain (President)
    Annie Morin, Irisa Rennes (Examinateur)
    Pieter M. Kroonenberg, University of Leiden, The Netherlands (Invité)
    François Husson, Agrocampus Ouest (Directeur de thèse)
    Jérôme Pagès, Agrocampus Ouest (Directeur de thèse)